С 1 января 2017 года представить пояснения к декларации по НДС можно только в электронной форме по ТКС (п. 3 ст. 88 Налогового Кодекса РФ) через оператора электронного документооборота. 

       Пояснения, представленные в бумажном виде, будут считаться не представленными.

       В случае выявления ошибок или противоречий при проведении камеральной проверки декларации по НДС, налоговая инспекция вправе запросить у налогоплательщика пояснения. Срок представления пояснений или уточнённой декларации - 5 рабочих дней со дня получения требования.

       Направить пояснения необходимо по утверждённому формату в электронном виде.

       Непредставление (несвоевременное представление) лицом в налоговый орган, предусмотренных п. 3 с. 88 Налогового Кодекса, пояснений в случае непредставления в установленный срок уточненной налоговой декларации, влечет взыскание штрафа в размере 5 000 рублей, а при повторном нарушении 20 000 руб. (п.1 и 2 ст. 129.1НК РФ).